4月2日晚，自治区人民政府新闻办公室召开新冠肺炎疫情和疫情防控工作情况新闻发布会。会上，自治区疾病预防控制中心首席专家倪明健通报了此次疫情流调溯源和病毒基因测序情况。
疫情发生后，迅速开展流调， “三公（工信、公安、公卫）”配合，摸清传播链，对选择防控措施控制疫情至关重要。本次疫情传播链相对清晰，乌鲁木齐市和昌吉市病例为早期发现。指示病例乘列车进入乌鲁木齐市，因其有疫情风险地区旅居史，即闭环转运至米东区集中医学观察点落实隔离医学观察，在例行核酸检测筛查中发现，昌吉病例在重点人群核酸检测中被检出，均做到了早发现。乌鲁木齐市、和硕县、昌吉市、库尔勒市第一时间对指示病例及续发病例的密接、次密接和时空伴随者进行管理，同时对涉疫区域及时划分风险区域实施封控，后续病例全部来自集中隔离场所，目前没有出现病毒外溢和疫情扩散情况。
目前，国内疫情点多、面广、频发，部分省市疫情高位流行，防控局面较为复杂，难度较大，形势严峻，我区“外防输入、内防反弹”的压力较大。和病毒赛跑需要大家做好个人防护，外出佩戴口罩，保持社交距离，减少非必要出行和聚集性活动，配合做好必要的管控和检测筛查，希望大家共同努力，尽快终结本次疫情。
